Muchos compuestos se purifican por cristalización a partir de una solución acuosa. El cristal excluye muchos contaminantes, sin embargo, el agua puede caber dentro de la red cristalina sin estar químicamente unido al catión del compuesto. La aplicación de calor puede expulsar esta agua, pero el proceso generalmente daña la estructura cristalina. Esto está bien, si el objetivo es obtener un compuesto puro. Puede ser indeseable cuando se hacen crecer cristales para cristalografía u otros fines.
A veces las dos formas se combinan. Por ejemplo, [Cu (H2O)4]ENTONCES4· H2O puede usarse para describir el agua de cristalización del sulfato de cobre (II).
El agua es una molécula polar pequeña que se incorpora fácilmente a las redes cristalinas, pero no es el único disolvente que se encuentra en los cristales. De hecho, la mayoría de los solventes permanecen, en mayor o menor medida, en el cristal. Un ejemplo común es el benceno. Con el fin de minimizar el efecto de un solvente, los químicos típicamente intentan eliminar tanto como sea posible mediante extracción al vacío y pueden calentar una muestra para eliminar el solvente residual. La cristalografía de rayos X a menudo puede detectar solventes dentro de un cristal.