1) Hokkaido
Área: 32,221 millas cuadradas (83,452 kilómetros cuadrados)
Capital: Sapporo
2) Iwate
Área: 5,899 millas cuadradas (15,278 km2)
Capital: Morioka
3) Fukushima
Área: 5,321 millas cuadradas (13,782 km2)
Capital: ciudad de Fukushima
4) Nagano
Área: 4,864 millas cuadradas (12,598 kilómetros cuadrados)
Capital: Nagano
5) Niigata
Área: 4,857 millas cuadradas (12,582 km2)
Capital: Niigata
6) Akita
Área: 4,483 millas cuadradas (11,612 kilómetros cuadrados)
Capital: Akita
7) Gifu
Área: 4,092 millas cuadradas (10,598 kilómetros cuadrados)
Capital: Gifu
8) Aomori
Área: 3,709 millas cuadradas (9,606 km2)
Capital: Aomori
9) Yamagata
Área: 3,599 millas cuadradas (9,323 km2)
Capital: Yamagata
10) Kagoshima
Área: 3,526 millas cuadradas (9,132 kilómetros cuadrados)
Capital: Kagoshima
11) Hiroshima
Área: 3,273 millas cuadradas (8,477 km2)
Capital: Hiroshima
12) Hyogo
Área: 3,240 millas cuadradas (8,392 km2)
Capital: Kobe
13) Shizuoka
Área: 2,829 millas cuadradas (7,328 km2)
Capital: Shizuoka
14) Miyagi
Área: 2,813 millas cuadradas (7,285 kilómetros cuadrados)
Capital: Sendai
15) Kochi
Área: 2,743 millas cuadradas (7,104 km2)
Capital: Kochi
16) Okayama
Área: 2,706 millas cuadradas (7,008 km2)
Capital: Okayama
17) Kumamoto
Área: 2,667 millas cuadradas (6,908 kilómetros cuadrados)
Capital: Kumamoto
18) Shimane
Área: 2,589 millas cuadradas (6,707 kilómetros cuadrados)
Capital: Matsue
19) Miyazaki
Área: 2,581 millas cuadradas (6,684 km2)
Capital: Miyazaki
20) tochigi
Área: 2,474 millas cuadradas (6,408 km2)
Capital: Utsunomiya
21) Gunma
Área: 2,457 millas cuadradas (6,363 km2)
Capital: Maebashi
22) Yamaguchi
Área: 2,359 millas cuadradas (6,111 kilómetros cuadrados)
Capital: Yamaguchi
23) Ibaraki
Área: 2,353 millas cuadradas (6,095 kilómetros cuadrados)
Capital: Mito
24) Oita
Área: 2,241 millas cuadradas (5,804 km cuadrados)
Capital: Oita
25) Mie
Área: 2,224 millas cuadradas (5,761 km2)
Capital: Tsu
26) Ehime
Área: 2,191 millas cuadradas (5,676 kilómetros cuadrados)
Capital: Matsuyama
27) Chiba
Área: 1,991 millas cuadradas (5,156 kilómetros cuadrados)
Capital: Chiba
28) Aichi
Área: 1,990 millas cuadradas (5,154 kilómetros cuadrados)
Capital: Nagoya
29) Fukuoka
Área: 1,919 millas cuadradas (4,971 kilómetros cuadrados)
Capital: Fukuoka
30) Wakayama
Área: 1,824 millas cuadradas (4,725 km2)
Capital: Wakayama
31) Kioto
Área: 1,781 millas cuadradas (4,613 km2)
Capital: Kioto
32) Yamanashi
Área: 1,724 millas cuadradas (4,465 km2)
Capital: Kofu
33) Toyama
Área: 1,640 millas cuadradas (4,247 kilómetros cuadrados)
Capital: Toyama
34) Fukui
Área: 1,617 millas cuadradas (4,189 kilómetros cuadrados)
Capital: Fukui
35) Ishikawa
Área: 1,616 millas cuadradas (4,185 kilómetros cuadrados)
Capital: Kanazawa
36) Tokushima
Área: 1,600 millas cuadradas (4,145 kilómetros cuadrados)
Capital: Tokushima
37) Nagasaki
Área: 1,580 millas cuadradas (4,093 kilómetros cuadrados)
Capital: Nagasaki
38) Shiga
Área: 1,551 millas cuadradas (4,017 km2)
Capital: Otsu
39) Saitama
Área: 1,454 millas cuadradas (3,767 km2)
Capital: Saitama
40) Nara
Área: 1,425 millas cuadradas (3,691 kilómetros cuadrados)
Capital: Nara
41) Tottori
Área: 1,354 millas cuadradas (3,507 kilómetros cuadrados)
Capital: Tottori
42) Saga
Área: 942 millas cuadradas (2,439 kilómetros cuadrados)
Capital: Saga
43) Kanagawa
Área: 932 millas cuadradas (2,415 km2)
Capital: Yokohama
44) Okinawa
Área: 877 millas cuadradas (2,271 kilómetros cuadrados)
Capital: Naha
45) Tokio
Área: 844 millas cuadradas (2,187 kilómetros cuadrados)
Capital: Shinjuku
46) Osaka
Área: 731 millas cuadradas (1,893 kilómetros cuadrados)
Capital: Osaka
47) Kagawa
Área: 719 millas cuadradas (1,862 kilómetros cuadrados)
Capital: Takamatsu
Fuentes:
Wikipedia.org. Prefecturas de Japón - Wikipedia, la enciclopedia libre. Recuperado de: http://en.wikipedia.org/wiki/Prefectures_of_Japan.